SMPN 9 Batam didirikan sebagai bagian dari upaya pemerintah Kota Batam untuk menyediakan pendidikan menengah yang berkualitas bagi masyarakat. Sejak berdiri, sekolah ini telah mengalami berbagai perkembangan dan peningkatan, baik dari sisi infrastruktur maupun prestasi akademik.
Awalnya, SMPN 9 Batam hanya memiliki beberapa kelas dan fasilitas yang sederhana. Namun, seiring berjalannya waktu, sekolah ini terus berkembang, dengan tambahan ruang kelas, laboratorium, dan fasilitas pendukung lainnya. Berkat dedikasi para pendidik dan partisipasi aktif dari masyarakat, SMPN 9 Batam berhasil meraih banyak prestasi di bidang akademik dan non-akademik.
Kini, SMPN 9 Batam menjadi salah satu sekolah unggulan di Kota Batam, dikenal karena komitmennya dalam memberikan pendidikan yang holistik dan berorientasi pada pembentukan karakter siswa. Sekolah ini terus berinovasi dalam metode pengajaran dan program-programnya untuk memenuhi tantangan pendidikan di era modern.